《惡魔的謎語(yǔ)》故事舞臺(tái)設(shè)定在一個(gè)名為“10年黑組”的全住宿制女子高中的班級(jí)，這個(gè)班級(jí)里的12名學(xué)生都是由暗殺者構(gòu)成的，她們?nèi)济闇?zhǔn)了她們的同學(xué)——一之瀨晴的性命。即使她的性命被眾多人覬覦，一之瀨晴依然發(fā)誓一定要活著畢業(yè)。另一方面，同樣也是準(zhǔn)備奪取一之瀨晴性命的暗殺者——轉(zhuǎn)校生東兔角卻在一次次接近對(duì)方時(shí)，漸漸地被晴所吸引。在同學(xué)們對(duì)晴展開(kāi)攻擊之時(shí)，兔角則以保護(hù)者的姿態(tài)與她們開(kāi)始了戰(zhàn)斗。